Todos los cursos a partir de 5º de Primaria cuentan con un Consejo de Curso compuesto por un delegado, un subdelegado y varios vocales dependiendo del número de alumnos de la clase. Son elegidos por los propios alumnos y a día de hoy ya están en funcionamiento en Las Fuentes.  

Los miembros del Consejo de Curso mantienen reuniones periódicas con el Profesor Encargado de Curso con la misión de servir a sus compañeros. En las reuniones, se tratan temas diversos  como pueden ser el rendimiento global de los alumnos en las distintas asignaturas, la distribución  de encargos y revisión de su cumplimiento, concreción y seguimiento de las ayudas especiales a los alumnos que las necesiten. Por otro lado pueden tratar aspectos de la vida colegial que puedan mejorar el ambiente de trabajo y compañerismo y la atención de las normas de convivencia y disciplina. Los alumnos pueden proponer otros temas y sugerencias para un mejor funcionamiento del colegio. En definitiva, con los Consejos de Curso perseguimos fomentar la iniciativa y confiarles tareas acordes con su edad y madurez. Resultan una ayuda eficaz en el gobierno de una clase.